Page 343 - LOS BOVINOS CRIOLLOS DE MÉXICO

CARACTERIZACIÓN GENÉTICA DE LOS BOVINOS CRIOLLOS MEXICANOS
Y SU RELACIÓN CON OTRAS POBLACIONES BOVINAS 343

Asignación de individuos a poblaciones con métodos multilocus
Estructura de la Población Criolla Mexicana

Se utilizó un algoritmo bayesiano del programa de análisis Structure (Pritchard et al., 2000), que

emplea un modelo basado en método de cadenas Markov de Monte Carlo, que estima la distri-
bución a posteriori de cada coeficiente de mezcla de cada individuo (q). La media de esta distri-
bución representa una estimación de la proporción que el genoma de un individuo tiene de las

poblaciones parentales. El algoritmo supone que las poblaciones ancestrales están en equilibrio

Hardy-Weinberg.
Con el programa Structure se realizaron dos análisis, el primero fue la asignación de los in-
dividuos a cluster, los cuales relacionan a los individuos más parecidos genéticamente y segundo,

determinar el número real de poblaciones, desde el punto de vista genético.

Para el primer caso, se realizó un análisis utilizando un algoritmo bayesiano suponiendo que
las frecuencias alélicas están correlacionadas y que las poblaciones en estudio están mezcladas.
Para cada modelo se realizaron una serie de corridas independientes para cada valor de K (núme-

ro de poblaciones) entre 1 y 5.

Los resultados presentados están basados en corridas de 10 iteraciones o más, seguidas a un
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periodo previo (burnin) de 100,000 iteraciones. En la mayoría de los casos se obtuvieron estima-
dores de verosimilitud consistentes entre corridas independientes. En el Cuadro 2 se presenta la

estimación de la probabilidad a posteriori de los valores asumidos de K, para asumir el valor real

de poblaciones (K), calculado de acuerdo a Pritchard et al. (2000).

Universidad Autónoma de Chiapas